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国自然专家 | 一分钟了解线粒体自噬

作为所有真核细胞的能量中枢,线粒体功能正常是维持细胞稳态的关键。一旦细胞和组织中ROS(活性氧)过度积累,则会导致线粒体损伤,引发线粒体DNA受损、膜电位改变、氧化蛋白活性改变,最终破坏细胞代谢稳态并导致细胞死亡。因此为了维持稳态平衡,细胞进化出了一种有效的线粒体质量控制手段—线粒体自噬(Mitophagy)。

一、什么是线粒体自噬?


在活性氧(ROS)胁迫、营养缺乏、细胞衰老等外界刺激的作用下,会导致线粒体DNA(mtDNA)突变逐渐累积,还会使细胞内线粒体膜电位降低和去极化损伤。为了维持线粒体和细胞稳态,防止受损线粒体损伤细胞,损伤的线粒体被特异性包裹进自噬体中并与溶酶体融合,从而完成溶酶体的降解,这个过程称为线粒体自噬(mitophagy)。简言之,线粒体自噬是一种通过特异性清除细胞质中功能失调的线粒体,从而维持线粒体功能的完整性和细胞稳态的选择性自噬。

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(DOI: 10.7150/thno.79876)


根据线粒体自噬过程的特征, 可将其分为4个关键步骤:

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1

前期线粒体受损后发生通透性转变,导致线粒体去极化,失去膜电位,诱导线粒体自噬相关蛋白活化;


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2

早期自噬体包裹受损线粒体,形成线粒体自噬体;


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3

中期线粒体自噬体与溶酶体融合后形成成熟的线粒体自噬溶酶体;


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溶酶体酸性水解酶流入自噬体降解线粒体,营养物质得以循环再利用。

二、线粒体自噬的分子机制


A、泛素依赖途径(Ubiquitin-dependent pathways)

泛素依赖途径的关键蛋白是PINK1和Parkin,因此也被称为PINK1–Parkin介导的线粒体自噬途径(PINK1–Parkin mediated mitophagy)。PINK1是一种位于去极化线粒体上的丝氨酸/苏氨酸激酶,而Parkin是一种E3泛素连接酶,可催化泛素转移到线粒体底物。


当线粒体膜电位(Mitochondrial membrane potential,MMP,Am) 受损时,PINK1 进入线粒体内膜的途径受阻导致 PINK1 在线粒体外膜的胞质面上稳定聚集。同时,这会募集并激活 Parkin,Parkin 蛋白酶的空间构象发生改变,转化为活化的 E3 泛素连接酶,然后泛素化线粒体上的蛋白质。PINK1 与Parkin 相互作用,共同调控线粒体自噬过程以维持线粒体质量。


此外,除了 PINK1-Parkin 通路之外,还有非 Parkin 依赖性的泛素依赖性通路。也就是说,PINK1还可以通过泛素磷酸化直接招募自受体蛋白(如 NIX、BNIP3 和 FUNDC1)到线粒体,受体蛋白募集 LC3,这使得自噬体能够吞噬线粒体。


B、非泛素依赖途径(Ub-independent pathways)

非泛素依赖的线粒体自噬是由线粒体自噬受体(Mitophagy Receptors)来主导,这与泛素依赖途径之间存在明显差异。


泛素依赖途径线粒体自噬的一个核心机制是磷酸化泛素的产生;而线粒体自噬受体如NIX、BNIP3和FUNDC1等都包含一个保守的LC3结合域(LC3-interaction region,LIR),他们可以通过LIR基序直接与自噬相关蛋白(ATGs,如LC3)结合,启动自噬。


在哺乳动物中,这些受体主要包括 Nip3 样蛋白 X (Nip3-like protein X,NIX) 受体bcl2 相互作用蛋白 3 (BCL2-interacting protein 3,BNIP3) 受体、FUN14 结构域包含 1(FUN14 domain containing 1,FUNDC1) 受体。

三、下面给大家分享一下线粒体自噬相关蛋白的检测方法


1、PINK1

PINK1由581aa组成,分子量约为63kDa。前面也讲到在稳态条件下线粒体上的PINK1会被切割水解,根据切割位点不同,会产生~52kDa或~48kDa截短形式。因此在正常生理条件下,PINK1全长形式存在较少。

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PINK1蛋白的结构及剪接机制


在自噬诱导条件(CCCP处理)下,PINK1不能易位到线粒体内膜,阻断了蛋白切割过程。PINK1与线粒体外膜复合物(TOM)相互作用并稳定在线粒体外膜上。FL-PINK1在线粒体膜上积累,在WB实验中可看到条带增强。

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PINK1蛋白的WB检测

注:CCCP是一种强效的线粒体氧化磷酸化解偶联剂,促使线粒体内膜对H+产生通透性,导致线粒体内膜两侧的膜电位丧失,诱导线粒体自噬。


2、BNIP3L/NIX和BNIP3

BNIP3L首先被发现为一种促凋亡的BCL2家族蛋白,可诱导细胞凋亡或坏死;不过最近的研究发现,BNIP3L可通过自噬促进网织红细胞的线粒体消除。


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BNIP3的免疫荧光检测

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