DGGE

微生物菌群多样性分析(DGGE)

DGGE即变性梯度凝胶电泳,是根据DNA在不同浓度的变性剂中解链行为的不同而导致电泳迁移率发生变化,从而将片段大小相同而碱基组成不同的DNA片段分开。

基本原理

DGGE不是将分子量不同的DNA分开,而是通过聚丙烯酰胺凝胶中变性剂浓度梯度的不同,将序列不同的DNA分开。该方法的原理是根据DNA 的解链特性,不同碱基组成的DNA双螺旋发生变性所要求的变性剂浓度不同,混合双链DNA在变性剂浓度呈线性梯度增加的聚丙烯酰胺凝胶电泳时,当泳动到与DNA变性所需变性剂浓度一致的凝胶位置时,相对应的DNA发生解链变性,导致电泳迁移速率降低。由于泳动受阻DNA分子在凝胶中的停留位置不同,从而使不同DNA分子得以分离。

DGGE 的特点

DGGE已广泛用于分析自然环境中细菌、蓝细菌, 古菌、微型真核生物、真核生物和病毒群落的生物多样性。这一技术能够提供群落中优势种类信息并同时分析多个样品,具有可重复和操作简单等特点, 适合于调查种群的时空变化, 并且可通过对条带的序列分析或与特异性探针杂交分析鉴定群落组成。

服务内容

1. DGGE分析不同环境样品的微生物组成。

2. DGGE胶图上条带的克隆测序。

3. 微生物多样性分析报告。

样品要求

客户最好提供直接从环境采集的样品,不建议客户提供提取好的DNA。并且客户取样完成后,需立刻放入-20℃条件下保存。不建议客户把样品长时间放在室温条件下。各种环境样品2～5g即可。

实验报告

实验完成后,本公司将提供给客户所有的实验过程以及每个环节的实验数据,最后提供给客户完整的实验流程及实验分析结果。如客户提出特殊要求需另议。

服务周期

DGGE 分析: 2-3 周