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首页 >> 技术服务 >>组学服务 >>转录组 >> 微量RNA测序
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微量RNA测序

目前,常规高通量测序建库对样品量的要求较高,许多来源稀少的细胞样品、exosome样品、肿瘤等临床样品以及一些提取困难、容易降解的特殊样品等由于难以获得足量的核酸而无法进行常规建库测序。

 

样本要求

• 样品类型:微量RNA样品

• 样品量:小于10 ng

• 样品保存:将RNA溶于RNase Free 的超纯水中,-80℃保存。样品保存期间避免反复冻融。

• 样品运输:样品置于1.5 mL管中,封口膜封好,冷冻运输。

 

测序方案

测序模式 PE150

测序数据量 10Gb clean data

 

生物信息分析内容

基础分析  

1 原始数据质控检查

2 比对结果质控检查

3 基于基因表达的样品主成分分析

4 差异基因表达及相关通路富集分析

5 circRNA预测及鉴定

6 circRNA差异分析

7 差异circRNA宿主基因的通路富集分析

8 差异circRNA的靶向miRNA预测分析

9 长链非编码RNA差异分析

 

高级分析 

10 基于基因表达的通路活性分析  

11 转录调控活性分析及通路互作分析

12 差异长链非编码RNA的调控基因的通路富集分析

13 circRNA及靶向miRNA网络调控制图


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